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Código abierto y bacterias - Bibliografía

 ****- (3 opiniones)
Creative Commons Monografía de Lluís Guiu - 20 de Diciembre de 2005
Temas Relacionados: InmunologíaMedicina generalGenética
5. Bibliografía



1 La replicación bacteriana es exponencial, siguiendo la fórmula 2 elevado a N, donde N=número de generaciones. Considerando que una nueva generación puede nacer cada veinte minutos, en pocas horas tenemos millones de bacterias.

2 Margulis, L. y D. Sagan. Microcosmos, Allen & Unwin, Londres, 1987. Para conocer la teoría seminal de Margulis sobre la evolución biológica, Margulis, L. et al., "Environmental Evolution: Effects of the Origin and Evolution of Life on Planet Earth“, MIT Press,1992.

3 Raymond E., "The Cathedral and the Bazaar, Revisión 1.39, 1998. http://www.tuxedo.org/~esr/writings/cathedral-bazaar y Vidal, M., "Cooperación sin mando: una introducción al software libre, 2000. http://www.sindominio.net/biblioweb/telematica/softlibre

4 Entendiendo por "programación evolutiva, algoritmos genéticos, programación genética e híbridos.

5 Borges A. y E. Costa, "Enhancing Transposition Perfomance
, 1999. http://eden.dei.uc.pt/~ernesto/EvoCo/papers/papers/1999/cec99_1.pdf

6 Evonet, "Models for the Parallelization of Genetic Algorithms

http://evonet.dcs.napier.ac.uk/evoweb/resources/flying_circus/tutorials/online_tutorial/04/index.html

7 Nos referimos a "organismos
entendidos en el contexto de algoritmos genéticos.

8 Aclaración de términos: "Computación universal: Equivalentes a una máquina de Turing universal. "Discreto: Los CA constan de unidades de espacio y tiempo definidas, discretas.

9 Capcarrere, S., "Cellular Automata and Other Cellular systems: Design & Evolution", 2002. http://lslwww.epfl.ch/~msc/THESIS/thesis.html

10 Ben Jacob, E., Bacterial Wisdom, Gödel's Theorem and Creative Genomic Webs, Physica A, 248:57-76, 1998. http://star.tau.ac.il/~inon/wisdom1/preprint.html

11 Buena parte de las obras de Margulis tienen un carácter marcadamente divulgativo(ver nota 2) , y van más allá del campo de la microbiología, para hundir sus raíces en el terreno del pensamiento, perfilando toda una visión del mundo a través de la óptica de las bacterias.

12 El activismo vírico se caracteriza por criptografiarse a si mismo para no ser detectado por el sistema, por lo que no es demasiado recomendable que expliquemos las acciones de guerrilla de comunicación que hemos llevado a buen puerto, ya que las exponemos a la identificación por parte del sistema. Por suerte hay un par de acciones de protesta en contra de la LSSI(Ley de Servicios de la Sociedad de la Información) -una de ellas con ingredientes de activismo bacteriano- que si podemos detallar:

Ficha técnica de la acción ¿Dónde está la autoridad competente?

* URL: http://www.manje.net/juegolssi/s

* Tipología de acción: activismo vírico, juego en flash vía web
* Objetivo básico: contribuir a crear un clima de opinión en contra de la LSSI, llegando a los grandes medios.

* Programación: Actionscript y html. Remodelación y mejora de flash existente bajo licencia GPL.
* Equipo de desarrollo: Lluís Guiu, Arbeka y kl2.
* Tiempo: dos semanas.
* Tamaño del juego: primera carga de 52 kb. y segunda de 112 kb.
* Técnicas de camuflaje: utilización de juego como caballo de troya memético, lenguaje humorístico, anonimización de ip's, mutación de personalidad con la creación de "Pere Rocallaura", distribución del juego mediante mirrors(esto permitió también la distribución de carga).
* Estrategia de propagación memética: escalada bottom-up siguiendo esquema de los tres firewalls.
* Medios infectados: medios independientes y anti-LSSI, edición digital de grandes medios, Europapress, edición en papel de Ciberpaís.
* Velocidad de propagación: muy rápida, propia del activismo vírico.

Ficha técnica de la acción Colaboremos con la LSSI

* URL: http://www.manje.net/juegolssi2

* Tipología de acción: activismo mixto vírico/bacteriano, juego participativo vía web
* Objetivo básico: visualizar los peligros de la LSSI a través de la participación directa de los internautas
* Programación: html y javascript, y uso de cgis externos de hosting gratuito.
* Equipo de desarrollo: Lluís Guiu, Arbeka, kl2 y Mercè Molist.
* Tiempo: un mes
* Técnicas de camuflaje: lenguaje humorístico, uso de personalidad "Pere Rocallaura", distribución de la web mediante mirrors
* Estrategia de propagación memética: escalada bottom-up

* Medios infectados: respecto al primer juego, mayor penetración en medios independientes y escasa incidencia en grandes medios. Por otra parte, destacable la mención de "Colaboremos con la LSSI" en la sesión del senado español de 20-6-2002 donde se debatió la ley, en la que un senador invitó a la ministra del MCYT a participar en el juego.
* Medición de participación: un total de 230 contribuciones en primera fase.




13 Utilización del pensamiento vírico en clave activista, visión del mundo a través de la óptica vírica: Guiu L., "Resistencia al Sistema: pensando como un virus", 2000 y "Introducción al activismo vírico", 2003.

14 Para la identificación de un fenómeno emergente(f.e.) podemos utilizar los criterios de Collier y Mullier. Ver Collier, J. C. y Muller, S.J., The dynamical basis of emergence in natural hierarchies, 1998. Versión traducida al español en http://www.sindominio.net/~xabier/textos/resumenes/collier_emergence.txt. En base a estos criterios, disponemos de modelos de vida artificial que permiten entender de forma diáfana(y interactiva) como se desarrolla un f.e., ya que lo reconstruyen y permiten variar las condiciones en que se desarrolla. Es el caso del paradigmático modelo de formación de bandadas virtuales de avoides de Craig Reynolds, que ha inspirado decenas de implementaciones: http://www.red3d.com/cwr/boids. Otro ejemplo de f.e. del que disponemos de modelos informáticos son los atascos de tráfico, que ilustran cómo de diferentes puede ser los comportamientos entre el nivel grupal -el atasco de tráfico- y el nivel individual, cada uno de los agentes que forman ese grupo -los vehículos-. Si uno observa este peculiar automáta celular on-line que simula el tráfico de vehículos(http://rcswww.urz.tu-dresden.de/ helbing/RoadApplet) podrá percibirse de que mientras los vehículos se mueven hacia delante, los atascos de tráfico que se producen, el fenomeno emergente resultante de observar esos mismos vehículos grupalmente como un bloque, ¡se mueven hacia atrás!.

15 Los biofilms son redes bacterianas muy resistentes que se forman por ejemplo en las cubiertas de los barcos o en las tuberías, a partir de una señal de comunicación llamado "el sentir del quorum". http://www.erc.montana.edu/Res-Lib99-SW/default.htm

16 La idea de "virus" es a nuestro entender, una de las bases del pensamiento neodarwinista de Richard Dawkins, que tanta influencia intelectual ha ejercido en el mundo científico y informático desde la publicación de El gen egoísta. El pensamiento "virus" se ha utilizado para justificar las tesis de la supervivencia del más apto y la competición excluyente como motores de la evolución biológica. De la misma forma, el estudio de las bacterias muestra con especial claridad la teoría de Margulis de la simbiosis (S.E.T.), la cooperación, la especialización, como motores de la evolución. Consideramos que el pensamiento bacteriano no invalida la otra cara de la moneda, esto es, el pensamiento vírico, sino que podemos contemplar a estos dos pensamientos aparentemente antágonicos, como dos mundologías, dos realidades virtuales a las cuales podemos acceder para obtener una visión diferente del mundo. O quizás mejor, no son mundologías. Si nuestro cerebro es una red creadora de mundo en tiempo real, podemos ver a estas realidades virtuales como software mental modificador/amplificador de nuestra recreación continua del mundo, tu mundo/mi mundo/nuestro mundo. Y por supuesto, nuestra realidad virtual preferida puede ser la bacteriana y esta premisa no nos impedirá en ciertos aspectos concretos contraponer pensamiento bacteriano a pensamiento vírico. Lo importante es reconocer la no exclusión mutua entre estos dos pensamientos.

17 Barandarian, X. y Guiu, L., “Metabolismo, comunicación y evolución en redes bacterianas y tecnológicas”, 2004.
Autor y licencia de 'Código abierto y bacterias - Bibliografía'
Lluís Guiu Extraído de: http://sindominio.net/biblioweb/s/view.php?CATEGORY2=5&ID=121

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