La sección "Métodos" debe incluir sólo informaciones disponibles en el momento de elaborar el plan o el protocolo del estudio. La información obtenida durante la realización del estudio pertenece a la sección "Resultados".
Selección y descripción de participantes
Se describirá, con claridad, la selección de los participantes en los estudios de observación o experimentales -pacientes o animales de laboratorio incluidos los controles- los criterios de elegibilidad y exclusión, así como una descripción de la población de origen. Debido a que la relevancia de variables como la edad y el sexo a los efectos del objeto de la investigación es en ocasiones ambigua, los autores deben explicar el uso de ciertas variables cuando se incluyan en el informe de un estudio; por ejemplo, deben exponer el por qué se incluyeron solo individuos de cierta edad o el por qué se excluyeron a las mujeres.
El principio guía es la claridad sobre cómo y por qué se realizó el estudio de una forma en particular. Si los autores emplean variables como la raza o el origen étnico, deberán definir cómo se midieron las variables y justificar su importancia.
Información técnica
Se identificarán, en detalles, los métodos, los equipos -con el nombre y la dirección del fabricante entre paréntesis- y los procedimientos para que otros investigadores puedan reproducir los resultados. Se hará referencia a los métodos establecidos, incluidos los métodos estadísticos (ver más adelante), se suministrarán las referencias y breves descripciones de los métodos publicados pero no muy conocidos; se describirán métodos novedosos o sustancialmente modificados junto con las razones para utilizarlos y se evaluarán sus limitaciones. Asimismo, se debe mencionar, con toda precisión, los medicamentos y productos químicos utilizados con sus nombres genéricos, dosis y vías de administración.
Los autores que presenten trabajos de revisión deben incluir una sección que describa los métodos empleados para localizar, seleccionar, recopilar y sintetizar los datos, estos se tratarán sintéticamente en el resumen.
Estadísticas
Se describirán los métodos estadísticos con suficientes detalles para que un lector conocedor con acceso a la información original pueda verificar los resultados presentados en el trabajo. Cuando sea posible, se cuantificarán los resultados y se presentaran con los indicadores correspondientes de error de medición o incertidumbre -por ejemplo, los intervalos de confianza. Se evitará la comprobación de la hipótesis estadística como única base de apoyo como sucede en el caso de los valores P que no transmiten información importante sobre la magnitud del efecto. Las referencias al diseño del estudio y los métodos estadísticos se harán a trabajos vigentes siempre que sea posible (con mención de las páginas). Se deben definir los términos estadísticos, las abreviaturas y la mayoría de los símbolos. Se especificará el tipo de software que se utilizó.